Cerrahpaşa Tıp Fakültesi’nin öncülüğünde 1985 yılında açılan Tıp Tarihi Müzesi, hizmete girdiği ilk yıllarda Tıp ve Eczacılık Tarihi Müzesi olarak tanıtılmıştı.
Müzedeki koleksiyon çeşitli resmi hastanelerden, emekli eczacı, doktor, hemşire ve diş hekimlerinde toplanan parçalarla genişletilmiştir. Müze binasının koleksiyonlar için küçük ve yetersiz olmasından dolayı şimdiki binası olan Tıp Fakültesinin en eski yapısına taşınmıştır. Tıp Tarihi Müzesi’nde Türk tıp tarihi ile ilgili el yazmaları, çeşitli cihazlar, aletler, cerrahi tedavide kullanılan malzemeler sergilenen eserler bulunmaktadır. Müze binasının her odası ve her bölümü koleksiyonlara göre düzenlenmiştir.
Tıp Tarihi Müzesi aynı zamanda bir araştırma merkezidir. İçerisinde bulunan belge ve fotoğraflar gibi somut örnekler sayesinde birçok kişinin araştırma yaptığı bir mekan haline de gelmiştir.